שומרי הנחלהניטור בוצע באוקטובר 2018 בשמונה תחנות לאורך הנחל, ממפגש הנחלים מגידו וקישון (אזור כפר ברוך) ועד לשפך הנחל לים התיכון, במטרה לאפיין את המצב האקולוגי של הנחל בתקופת סתיו 2018. בשל השינויים ההידרולוגיים והפיזיקו-כימיים בנחל, המלווים בשינויים מורפולוגיים הנובעים מעבודות תשתית נרחבות לאורך האפיק, אפיון הנחל המתבסס על מדדים כימיים בלבד אינו משקף את מכלול ההשפעות על מצב הנחל. לפיכך, הסקר הנוכחי התמקד בחברת חסרי החוליות הגדולים כמדד ביולוגי להערכת המצב האקולוגי של הקישון.
הניטור בוצע ע"י המרכז הלאומי לאקולוגיה אקווטית, מוזיאון הטבע ע"ש שטיינהרדט – אוניברסיטת תל אביב ורשות נחל הקישון.