המערכת התחתונה של נחל קישון נדגמה בסתיו 2019. שבע תחנות נדגמו לאורך נחל הקישון המלוח. מטרות הניטור הינן לעקוב אחר שינויים מרחביים, עונתיים, ורב שנתיים באוכלוסיות המיקרואצות אצות (פיטופלנקטון) והחיידקי, וקצב פעילותם (יצרנות ראשונית וחיידקית), בחלקו המלוח של נחל קישון ואת התנאים הסביבתיים הנלווים